大赛介绍

随着测序技术的发展及测序数据的积累,传统常规生物信息学在处理海量生物学数据时面临着不同程度的挑战。作为“十四五”国家重点研发计划,BT与IT融合(生物与信息融合)是解决目前生命科学研究中数据挖掘挑战的重要手段。基于此,在中国生物信息学学会(筹)、广东省科技基础条件平台中心的指导下,深圳国家基因库、鹏城实验室、深圳华大生命科学研究院发起2022“猛犸杯”国际组学数据创新大赛,旨在为生命科学领域现有科研问题及挑战提供解决方案,引领生命科学大数据产业创新发展;同时为生命科学、医学、计算机科学等多领域的专业人才搭建跨领域、跨学科的技术交流平台,激励生命科学大数据人才的创新意识和综合技能,推进BT与IT融合(生物与信息融合)发展。

竞赛单位

中国生物信息学学会(筹)、广东省科技基础条件平台中心

深圳国家基因库、鹏城实验室、深圳华大生命科学研究院

七牛云、镭速、英特尔、哈尔滨工业大学(深圳)、深圳市猛犸公益基金会

腾讯、H3C、荣联科技

华大时空、华大智造、“一带一路”生命科技促进联盟、基迪奥生物、裕策生物、华大基因学院

SAGE出版公司

大赛设置

本次大赛总共安排 2 个赛道,赛题内容分别为“时空组学细胞数据分析赛道”、“精准宏基因组丰度计算赛道”。

时空组学细胞数据分析赛道

时空组学技术Stereo-seq,是一项能够实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的原位捕获空间全转录组测序技术。主办方希望参赛者可以在保证分析结果准确率的前提下,应用/改进/研发适用于时空组数据预处理以及聚类的算法,实现减少算法运算内存消耗,提升运算速度等目标。

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精准宏基因组丰度计算赛道

宏基因组分析就是对特定环境样本内所有微生物(包括病毒,古菌,致病菌等)DNA进行提取、测序并分析其微生物组成和功能等的方法。为了提高微生物profile的准确度,主办方将提供模拟数据,希望参赛者可以开发或优化获得更精准的profile算法,同时能兼顾内存占用、运算速度。

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赛事流程

初赛

6月8日-8月2日

大赛报名,发布初赛数据,开放初赛提交。报名截止:8月2日23:59:59。各赛题前50名进入复赛阶段。

8月8日-9月20日

复赛

复赛评审

9月26日-10月14日

对各赛题复赛排行榜前15名的选手进行代码审核。各赛道通过审核排名前10的团队进入决赛阶段。

10月17日-11月4日

决赛

决赛路演

11月5日

组织决赛路演及颁奖。

注:以上时间若有变动,以官方最新公布为准。

大赛奖项

大赛奖金池金额:¥10W+; 分别设立一、二、三等奖、优秀奖。
获奖参赛团队都将获得竞赛官方认证证书,并且有机会获得面试推荐机会。

时空组学细胞数据分析赛道:
奖项 奖金(元) 奖品 数量(支)
一等奖 30,000 个人基因组VIP检测 1
二等奖 15,000 个人基因组VIP检测 1
三等奖 10,000 个人基因组VIP检测 1
优秀奖 3,000 个人基因组检测 7
精准宏基因组丰度计算赛道:
奖项 奖金(元) 奖品 数量(支)
一等奖 10,000 肠道微生物检测 1
二等奖 5,000 肠道微生物检测 3
三等奖 2,000 肠道微生物检测 6
优秀奖 0 肠道微生物检测 20

竞赛成果发布特刊

选定SAGE出版集团下的 Science Progress期刊(影响因子:2.7)申请特刊,发表大赛成果。

Science Progress期刊